Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TTLL9Q3SXZ7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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