Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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