Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms