Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms