Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRIM25Q14258 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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