Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms