Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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C1orf61Q13536 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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C1orf61Q13536 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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C1orf61Q13536 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
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C1orf61Q13536 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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C1orf61Q13536 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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