Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms