Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms