Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ACACAQ13085 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACACAQ13085 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms