Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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STRN3Q13033 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STRN3Q13033 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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