Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP2C1P98194 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms