Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SUMO1P63165 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms