Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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