Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms