Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PSMB4P28070 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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