Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA2P25787 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms