Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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