Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODC1P11926 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODC1P11926 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms