Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI1P08151 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI1P08151 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms