Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RAPGEF3O95398 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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