Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GCATO75600 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GCATO75600 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms