Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SCN2BO60939 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCN2BO60939 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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