Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSL4O60488 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSL4O60488 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSL4O60488 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms