Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXTL3O43909 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms