Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms