Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms