Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms