Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XAB2Q9HCS7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms