Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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