Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms