Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDAC8Q9BY41 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HDAC8Q9BY41 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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