Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms