Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms