Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
COPS9Q8WXC6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms