Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLEC4CQ8WTT0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLEC4CQ8WTT0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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