Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms