Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms