Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRIG3Q6UXM1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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