Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms