Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms