Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CNPY1Q3B7I2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms