Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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