Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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