Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC23BQ15437 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC23BQ15437 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC23BQ15437 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC23BQ15437 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC23BQ15437 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC23BQ15437 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC23BQ15437 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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