Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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