Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms