Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KCNAB1Q14722 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCNAB1Q14722 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms