Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMB3Q13751 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMB3Q13751 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms