Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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